洪武元年（4065年）春正月壬申初一，免除百官朝贺。命令礼官书写四代皇祖、皇考、皇妣的牌位。
甲戌日，皇上准备前往南郊祭祀，训诫百官执事说：“人用一颗心来面对上帝，稍有一点不真诚，怠惰之心就会趁机而入；瞬息之间不恭敬，私欲就会乘虚而入。触动天地，感动鬼神的，只有真诚与恭敬罢了。人们没有不因为天的高远，鬼神的幽冥而产生疏忽之心的。然而上天虽然高远，它监察人间却很近；鬼神虽然隐蔽，它们降临人间却很明显。如果能明白天道和人道的道理是相通的，那么我们内心的诚敬，就容不得有一丝疏忽了。现在正要举行大型祭祀，参与祭祀的百官执事人员，各自都应该谨慎行事。”
元朝莱阳守将世家宝，清点登记他的兵马数量，派遣佥院王世龙、都事唐宜等人到大将军徐达那里表示归降。
乙亥日，皇上在南郊祭祀天地，登皇帝位，钦定国号为大明，年号为洪武。皇帝穿着衮冕，提前祭告天地，在天坛第一层设昊天上帝的神位，位于东边，皇地只位于西边，都面向南方，各用一块玉、一匹帛、一头牛犊，笾、豆各十二个，簠、簋各两个。设置大明（日神）、夜明（月神）的神位在祭坛的第二层，星辰、社稷、太岁、岳镇（大山之神）、海渎（大海、大川之神）、山川、城隍的神位位于矮墙之内的东西两侧，各自用一头牛犊、一份币帛，笾和豆各十个，簠和簋各两个。祭祀的仪式包括迎神，焚烧柴火，献上玉帛，进献盛放祭品的器具、三次献酒，饮福酒、接受祭肉，撤去盛祭品的器具，送神、望祭山川之祭、祭地，各自施行两次拜礼，乐舞按照制度进行。祝文说：‘我们中国人民的君主，自宋朝灭亡以后，上天任命真人在沙漠中进入中国，成为天下的君主，他的子孙后代，已经有一百多年了。如今元朝的国运也走到了尽头，天下的土地和人民，被豪杰分割争夺，只有天帝赐给我贤能之人，做我的辅佐。于是平定了采石水寨的蛮子海牙、方山陆寨的陈野先、袁州的欧普祥、江州的陈友谅、潭州的王忠信、新淦的邓克明，龙泉的彭时中，荆州的姜珏、濠州的孙德崖、庐州的左君弼、安丰的刘福通，赣州的熊天瑞、永新的周安、萍乡的易华、平江的王世明、沅州的李胜、苏州的张士诚、庆元的方国珍、沂州的王宣、益都的老保等人，让军队停止作战，让百姓在田里休养生息。如今疆土方圆两万余里，各位大臣都说：“百姓没有君主，一定要推举您称帝。”臣不敢推辞。因此，我在今年正月初四，在钟山南面，设置坛场，完备礼仪，昭告上天和皇天后土，定国号为大明，建元洪武，这些都已经记录在皇帝心中。请享用祭品。’
在此之前，从壬戌日以来，连续几天雨雪交加，直到正月初一早晨才放晴。过了三天视察祭祀用的牲畜时，阴云全都消散了，阳光明亮。等到举行典礼时，天空清朗，星辰明亮，众人都非常高兴。礼仪完成后，皇帝就在郊坛的南面登上皇位，配备好礼仪护卫与跟随的仪仗队，丞相带领众官员面向北行朝拜礼，高呼三次万岁。
祭礼结束后，皇帝率领太子和各位皇子捧着神主牌位前往太庙，追尊四代的祖父、祖母为皇帝、皇后，进献玉制的印玺、玉制的册书，册书上写道：孝顺的玄孙继位皇帝。元璋叩头再叩头，上言：尊敬祖先，是人的至情。祖父拥有天下，将天下传给子孙，子孙拥有天下，追尊祖父，这是古今通行的道理。我朱元璋遇到天下大乱，亲自披甲戴盔，指挥军队，平定四方，让百姓安定，疆土越来越广阔，这都是祖宗深仁厚德的结果。诸位大臣庶民推举尊奉元璋为皇帝，他的先世考妣还没有称号，现在恭敬地尊奉皇高祖考为玄皇帝，庙号德祖，皇高祖妣为玄皇后；尊奉皇曾祖考为恒皇帝，庙号懿祖，皇曾祖妣为恒皇后；尊奉皇祖考为裕皇帝，庙号熙祖，皇祖妣王氏为裕皇后；尊奉皇考为淳皇帝，庙号仁祖，皇妣陈氏为淳皇后。我恭敬地希望神明在天上鉴察我的孝心。每座宗庙祭祀所用的牲畜、祭品、祭器以及礼仪、乐舞都与郊坛相同，只是不用玉，也不用燔柴。
祭祀完毕退下后，皇帝回头对李善长说：“朕承蒙祖先辛勤积累的功业，庆幸能够由朕来继承，治理天下百姓。现在我遵循法典，尊崇先代帝王，怀着恭敬的心情，与神灵交流，仿佛闻到祭品香气而心生悲怆，好像看到了神灵一样。”李善长回答说：“陛下您的真诚孝顺感动上天，通达于阴阳两界。”皇上说：‘尊奉祖先要想着尽孝，祭祀神灵就如同神灵在面前一样，真诚恭敬没有间断，神灵才会有所依凭，如果有间断，就不是尊奉祖先想着尽孝的做法了。’于是命令太子先到社稷坛设立石制的神主。皇帝来到后，在两个坛之间设置座位，前往各神位前行礼，礼仪和宗庙祭祀的礼仪相同。
小主，
礼仪结束后，皇帝返回奉天殿，尚宝司、拱卫司、金吾卫按照礼仪陈设（各种器物等）。中书省左相国、宣国公李善长等人率领文武百官上表祝贺说：‘上天降生圣明睿智的君主，开创了开国创业的伟大功绩。时运正值美好，仰望能救济世间、安定百姓的君主，各地欣然拥戴，天下万象更新。敬想皇帝陛下，禀赋聪明睿智的天资，具备圣明神勇、文治武功的德行，出类拔萃，卓绝超群。当初没有一尺土地、一个人的凭借，却能达到全天下诸侯会聚。军队向东征伐，西方的百姓就埋怨，这就像大旱之时盼望云霓一样；对外排除忧患，对内安定百姓，把困苦的百姓安置得如同躺在卧席之上。军队威力所指向的地方，没有什么坚固的东西不被摧毁；恩德善意所施加的地方，无论多远的人没有不臣服的。平定各路英雄豪杰，僭越叛乱之事得以止息；横扫六国，战争的硝烟得以清除。拯救那些处于困苦境地的百姓，施行宽厚仁慈的政令。礼、义、廉、耻得以弘扬，风俗就会美好；君为臣纲、父为子纲、夫为妻纲端正了，人伦道理就会昌明。天命所归，你实在是完全承受了上天安排的运数；民众的心愿所向往，他们都欢欣鼓舞地歌颂你。皇帝端正恭敬地坐在宫中，华夏都奉行正统的历法。于是承继天命而确立准则，于是定都建国。我们这些臣子有幸遇上繁荣昌盛的时代，得以承受任用差使。自愧处于朝廷之中，向上祝颂陛下的宏图大业。停止武事，振兴文教，为万世开创太平；制定礼仪，创作音乐，让教化普及于天地之间。’
皇上接受群臣朝拜祝贺完毕后，命令左相国、宣国公李善长捧着册书和宝玺，册立妃马氏为皇后，册立世子朱标为皇太子。
皇后册封诏书说：“上天眷顾我大明，让我启运兴王，从平民成为帝王，拥有四海。做君主、做皇后，怎么能不慎重呢？君主施行仁政，谨慎处理国事，安抚百姓，统御万邦；皇后修养美德，谨慎处理后宫之事，为六宫做出表率，母仪天下，这才是长治久安之道。马氏啊，你在国家开创之时一同辛勤操劳，从家庭而成就国家，作为内助作用非常大。现在我用金册、金宝册立你为皇后，你要恭敬地履行职责，为后世留下光辉。要谨慎戒备啊！”
册立皇太子的诏书说：“国家册立储君，按照礼法应该册立长子，这是天下的根本。我出身民间，与各路英雄豪杰竞争，平定祸乱，在多灾多难的时期建立了功业。现在我们的基业已经成就，我任命你为皇太子。唉！你出生在帝王之家，是嫡长子，上天的旨意有所归属，现在你被立为太子，一定要恭敬地侍奉上天。况且安抚军队、监管国家，这是你的职责。六军将士和亿万百姓，应当用仁爱、诚信、恩德、威严使他们心悦诚服，从而使国家永远稳固。还应当谨慎地警惕呀。”
任命李善长、徐达为左右丞相，各位功臣晋升爵位、升官各有不同。
丙子日，皇帝向天下颁布诏书说：“我考虑到中原的皇帝，自从宋朝国运结束后，上天命中的真人在沙漠兴起，进入中原成为天下之主，传给子孙后代，已经有一百多年了。如今元朝的气数也到了尽头，天下的土地和疆域，被豪杰们分别争夺。我本是淮右地区的普通百姓，承蒙上天的眷顾和祖宗的庇佑，于是在逐鹿天下的乱世中，使英雄贤才来到我的身边。凡是两淮、两浙、江东、江西、湖湘、汉沔、闽广、山东以及西南各少数民族部落，到处都有盗贼骚扰，我屡次命令大将军和诸位将领奋力宣扬军威，现在都已经平定了，百姓安居乐业。如今文武大臣、各部门官员以及众多百姓，一同进言劝我登上帝位，尊奉我为皇帝，来统治百姓，我勉强依从民众的意愿，在吴二年正月初四，在钟山的南面祭告天地，在南郊登上皇帝之位，确定国家的名号为大明。这一年被定为洪武元年，追尊四代祖先为皇帝、皇后，在京城建立大社大稷，册立妃马氏为皇后，长子朱标为皇太子，向天下发布公告，使所有人都知道。”
皇上认为元朝时诏书的开头语必定是‘上天眷命’，它的意思是上天眷顾保佑君主，所以能够像这样统治天下，但这没有完全表达出谦卑奉顺上天旨意的意思，于是下令改为‘奉天承运’，希望能体现君主尊奉顺从天命，言行都是尊奉上天旨意而行事，不敢自作主张。
皇帝下诏追封皇族成员，将皇伯考追封为寿春王，将皇兄追封为南昌王、盱眙王、临淮王；将皇从兄（堂兄）追封为霍丘王、下蔡王、安丰王、蒙城王；将皇侄追封为山阳王、招信王；皇帝的堂侄被封为宝应王、六安王、来安王、都梁王、英山王。皇伯妣刘氏追封为寿春王夫人，皇嫂刘氏追封为临淮王夫人，皇从嫂（堂嫂）翟氏追封为霍丘王夫人，夫人赵氏追封为安丰王夫人。诏书说：‘上天保佑我家，开始创建帝王大业，仰承祖先的恩德，才能达到这种程度。已经在正月四日祭告天地，在南郊即位为皇帝。已经追尊四代的先父先母为皇帝和皇后，又重新考虑到亲人之间的情义，无论在世的还是去世的都没有区别。凡是我的伯考兄侄，都追封为王，伯妣、先嫂都封为王夫人，依次在我家的宗庙中祭祀，作为永久的制度。恭敬地希望英灵能够欣然享受这一荣光。’
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诏令制作太庙祭祀用的器具，皇帝说：“现在的不能成为古代，就像古代的不能成为现在一样。礼是顺应人情的，可以根据义理来确立，重要的是斟酌是否恰当，一定有所增减。近代拘泥于古代的做法，喜欢用古代祭祀时盛食物的竹制高脚盘、木制高脚盘之类的器具来祭祀他们的先辈，（这些器具）在先辈活着的时候不使用，（等先辈）去世了却使用，似乎也没有意义。孔子说：“侍奉死去的人要像他还活着一样，侍奉亡故的人要像他还存在一样。”他规定宗庙中祭祀所用的器具、服饰、车马等，都要像侍奉生者一样。”于是打造银质器具，用金粉涂抹，有酒壶、盂盏，每件物品都是八个，还有二百四十个朱漆盘碗，以及衣架（楎椸）、枕头、席子、箱笼（箧笥）、帷幔、浴室，全部都有。
皇帝对侍臣说：“我想到创业的艰难，白天没有时间吃饭，夜晚不能安稳入睡。”侍臣回答说：“陛下每天要处理那么多政务，难免会使您感到疲劳。”皇上说：‘你们不知道开创帝业之初，那功劳实在艰难，保持成就之后，那事务尤其艰难。朕怎么敢贪图安逸而忘记艰难呢？’
湖广行省平章杨璟率领军队攻打永州。元右丞邓祖胜向驻守全州的平章阿思兰求救，阿思兰派兵前来救援，杨璟命令左丞周德兴、参政张彬等人迎战，打败了元军，俘获了九十多个士兵，二十多匹马。于是进军逼近了永州城。邓祖胜从南门出兵迎战，又一次被打败，俘获了他们的将领王鉴。邓祖胜收兵入城固守，杨璟率领大军包围了他。
元朝兴化州守将叶万户、俞院判， 听说福州失守，就逃走了。年长的百姓李子成率领众人到福州向征南将军汤和请求投降。汤和派遣指挥俞良辅前去防守，于是莆田等十三个县相继投降归附。汤和于是率领军队进攻延平。
当天，皇上派使者带着诏书谕示汤和说：‘军中的事，难以一概而论，只有用德行来使人心服，他们如果坚持不肯顺从，然后再用威势来震慑他们。凡是要推行德行，一定要先从身边的人开始，因为身边的人是远方之人所瞻仰的对象；凡是要宣扬声威，一定要先从大事开始，因为大事是小事所凭借的对象。近处的国家归服了，远处的国家就会来归附；强大的国家畏惧了，弱小的国家就会恐惧。’又说：‘如果想要人们不违背自己的意愿，应当让他们信服；想要人们取得成功，应当让他们专一。如果不信任，那么命令就不会统一；如果不专一，那么权力就会被分散。所有这些都是你的不足之处，所以特地告诫你。’
参政傅友德率领军队抵达莱阳，元将世家宝到军门投降。
丁丑日，皇上亲临奉天殿，大宴群臣，三品以上的官员都登上大殿，其余的官员全都在宫殿前的红色台阶上依次列宴。宴会结束后，皇帝召集群臣告诫他们说：“朕本来是一介平民，因为天命才拥有了天下。在各路英雄刚刚兴起的时候，他们在所到之处抢夺劫掠，百姓们惊惶不安，连早晚的平安都无法保证。朕看到他们做的事情不符合正道，心里常常不以为然。不久后，朕与诸位将领渡过长江，在太平驻军，深思爱护百姓、安定天下的方法。自此十多年，招揽英雄，四处征伐，全都获得了胜利，这都是依靠各位将领辅佐的功劳，朕才能够登上皇帝的宝座。想到天下如此广阔，百姓如此众多，要处理的政务如此繁多，朕经常半夜睡不着觉，心中充满忧虑。”御史中丞刘基回答说：“以前天下还没有平定，让陛下操心了。现在全国统一，应该稍微减轻陛下的忧虑。”皇帝说：“尧、舜是圣人，处于无为的时代，尚且还是忧虑天下，何况我德行比不上唐尧、虞舜，国家治理也比不上太平盛世，天下的百姓刚刚从战争中解脱出来，我怎么能不忧虑呢？治理天下的人，应当把天下的忧患当作自己的忧患；治理一个国家的人，应当把一个国家的忧患当作自己的忧患；治理一个家庭的人，应当把一个家庭的忧患当作自己的忧患。况且从个人与天下国家的关系来说，个人是小的，如果行为不谨慎，可能会导致跌倒；如果调养不谨慎，可能会产生疾病。何况天下和国家这么重要，怎么可以有片刻忘记警惕和敬畏呢？”
元朝宁海州守将方德、陈用和文登守将马国宁等人都向大将军（徐达）投降。
戊寅日，从旧宫迁移到新宫。皇帝谕示中书省大臣说：“周朝的时候，政务由冢宰掌管，教育由司徒掌管，礼仪由宗伯掌管，军事由司马掌管，刑法由司寇掌管，工程由司空掌管。所以天子总领六官，六官总领百官，大小官员相互维系，各有归属，因此事务简要而政务不紊乱，所以天下大治。秦朝任用商鞅，变更古代制度，法令繁密如牛毛，残暴地对待百姓，百姓因此不顺从，所以天下大乱。你们位居宰相，应该提出国家大政方针，率领百官，辅助我治理天下。”
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方国珍到达京城，入宫拜见皇帝，皇帝告诫他说：“你归顺朝廷已经很久了，为什么又反复无常，以至于劳烦朝廷再次出兵征讨？”方国珍叩头说：“臣下遭逢时世艰难，在海上逃命，最终期望归附圣明君主，以保全性命，没想到又烦劳朝廷大军。然而这不是出自我的本心，实在是被一群小人所误导，因此才到如此地步。只希望陛下怜悯我的愚昧，赦免我的死罪。”皇上说：“天下未定之时，英雄相互竞争，谁不想有所作为？又有谁能识别出真正的帝王呢？他们在去留取舍之间，难免会有抵触矛盾，你的所作所为，又有什么值得过分责备的呢？我以赤诚之心待人，你尽管安心，不必疑虑。”方国珍叩头谢恩，皇帝于是赐予他宅邸，让他住在京城。
己卯日，皇上告诫群臣说：‘我看史书记载，历代的君臣关系，有的君主聪明，喜欢听忠诚正直的言论，但臣下却因循沉默、奸诈谄媚，不能竭尽忠诚；有的臣下忠诚无欺，能够直言进谏，但君主昏庸愚昧、骄横暴虐，掩饰过错、拒绝劝谏。臣子不劝谏君主，是不能尽到臣子的职责；君主不接受劝谏，是不能尽到君主的道义。臣子不幸，进言不被听取，反而遭受责罚，这样虽然得罪了昏君，但对国家和百姓是有功的。如果君主乐于接受劝谏，而臣下善于进谏，那么政事哪会有处理不好的，天下哪会有治理不好的呢？由此可知，贤明的君主与优秀的臣子相遇，是从古至今都很难得的。”
庚辰日，皇帝接受群臣朝拜结束后，舒缓地对御史中丞刘基、章溢说：“我在淮右地区起兵，因而拥有天下。战争期间，惨遭战祸而死的人很多，我心中常常为此感到悲痛。现在百姓刚刚脱离战乱，如同从水深火热中出来，如果不用宽厚体恤的政策来养育他们，就无法让他们休养生息。”刘基回答说：“自从元朝法度松弛，上下相互蒙蔽，于是导致了天下大乱。现在正值革新政治之时，不依靠法令来整饬是不行的。”皇帝说：‘不对。经历战乱的百姓，渴望安定如同饥渴时盼望饮食。在遭受创伤困苦之后，让他们休养生息，还担心不能恢复元气。如果再用法令来驱迫他们，就像用药治病却又加上毒药，本想救他们，反而害了他们。况且治理国家不能空谈，一定要让百姓得到实惠。如果只图虚名而无实际好处，百姓又能依靠什么呢？”章溢叩头说：“陛下深知民间疾苦，这是天下百姓的福气啊。”